（1）有限公司和个人独资企业的选择

目前，许多地区对公司和个人独资实行不同的纳税规定。公司的营业利润在企业环节课征公司税，税后利润作为股息分配给投资者，投资者还要缴纳一次个人所得税。而个人独资则不作为公司看待，营业利润不交公司税，只课征投资人分得收益的个人所得税。例如，某纳税人甲经营科研中心，年盈利4000000元，该科研中心如个人独资只征个人所得税，依现行税制税后利润为392.55元，【4000000-（4000000*10%*35%-65500）】;该中心如按公司课征所得税，税率40%，税后利润3000000元全部作为股息分配，纳税人甲还要交纳一道个人所得税600000元（3000000X20%）。这样，其净得税后收益只有2400000元。与前者相比，多负担所得税152.55元（160-7.45）。面对公司税负重于个人独资企业税负的情况，纳税人作出了不组织公司，而办个人独资企业的决策。纳税人甲的这一举动是法律规定所许可的，在纳税行为未发生之前进行筹划，并达到了节税的效果。

（2）子公司和分公司的选择

当一个企业进行国外或外地投资时，它可以在建立常设机构、分公司或予公司之间进行选择。由于一些低税国、低税地区可能对具有独立法人地位的投资者的利润不征税或只征收较低的税收，并与其他国家、地区广泛签订了税收协定，对分配的税后利润不征或少征预提税。因此，跨国法人常乐于在这些低税国家、地区建立子公司或分公司，用来转移利润，逃避高税国税收。

从法律上讲，子公司是一个独立的法人，而分公司则不是一个独立的法人。从税务的角度讲，不论是子公司，还是分公司，都应在其所在国缴纳所得税。但是，大多数国家对在该国注册登记的公司法人（子公司）与外国公司设在该国的常设机构（分公司）在税收上是有不同规定的。前者往往承担全面纳税义务，后者往往承担有限纳税义务。此外，在税率、优惠政策等方面，也互有差异。这在设立公司时，是必须筹划的一个问题。

分公司的税收待遇往往不同于子公司。许多国家对外国公司的分支机构利润，除征收公司所得税外，还要开征一种"分支机构税"。如分支机构成为外国公司的子公司时，此税相当于对其分配股息所征的所得税额。多数国家征收分支机构税时，是就分支机构扣除应征的公司所得税后的全部利润征收，即使事实上并无汇出利润也要征收此税，即不考虑这笔利润是否汇往总公司作为股息。也有些国家只就分支机构未再投资于固定资产的利润征税。还有些国家只就利润的汇出部分征税，也称为"汇出税"。我国原件外合资经营企业所得税法中规定对外资企业汇出利润课征 10%的预提税即属于这一性质。

对跨国公司而言，将其某些附属机构设为子公司，而将另一些设立为分公司，从的角度出发，应从以下方面加以考虑：

（1）设立于公司在东道国只负有限责任的债务（虽然有些需母公司担保），但设立分公司时，总公司则需负连带责任。

（2）东道国适用税率低于居住国时，子公司的累积利润可得到递延纳税的好处;另外，某些国家子公司适用的所得税率比分公司低。

（3）许多国家允许在境内的企业集团内部公司之间的盈亏互抵，子公司就可以加入某一集团以实现整体利益上的。设立分公司时，在经营的初期，境外企业往往出现亏损，分公司的亏损可以冲抵总公司的利润，减轻税收负担。

（4）于公司有时可以享有集团内部转移固定资产增值部分免税的税收优惠;而设立分公司时，因其与总公司之间的资本转移，不涉及所有权变动，不必负担税收。

（5）子公司向母公司支付的诸如特许权、利息、其他间接资等，要比分公司向总公司支付，更容易得到税务认可。

（6）子公司利润汇回母公司要比分公司灵活得多，资本利得可以保留在于公司，或者可以选择税负较轻的时候汇回，得到额外的税收利益;而分公司交付给总公司的利润通常不必缴纳预提税。

（7）母公司转售境外子公司的股票增值部分，通常可享有免税照顾，而出售分公司资产取得的资本增值要被课税。

（8）境外分公司资本转让给子公司有时要征税;而子公司之间的转让则不征税。